Dalam proses belajar mengajar di sekolah, fasilitas atau sarana dan prasarana merupakan salah satu bagian yang paling penting, karena dapat membantu kelancaran dan kenyamanan dalam proses belajar di sekolah, Fasilitas di SMK Insan Cendekia Yogyakarta sangatlah lengkap, SMK Insan Cendekia Sleman mempunyai gedung Sekolah dan fasilitas lengkap. Setiap jurusan mempunyai gedung sendiri. Yang paling menarik bagi para penggemar Foot Ball, SMK Insan Cendekia mempunyai lapangan bola sendiri .